一、背景介绍

生物体内 Total RNA中rRNA占比高，但是可以提供的有效信息少，这些RNA会产生大量的没有价值的数据，对于获取生物信息研究意义不大，同时，占比较高的rRNA，使得mRNA在转录本中相对丰度低，从而影响低丰度的转录本的检测。因而在常规的RNA 测序（RNA-seq）中，rRNA的有效去除对于实现RNA经济高效的测序至关重要。

二、产品描述

（一）MaxUp 系列rRNA去除试剂

MaxUp 系列rRNA去除试剂基于RNase H消化法去除样本总RNA（Total RNA）中的核糖体RNA（rRNA），以保留信使RNA（mRNA）和其它非编码RNA。针对的样本类型丰富,起始量范围广泛，全流程仅需不到2h，手工操作的时间少于10min。同时针对常规样本和低质量样本（如FFPE类）均可对rRNA高效去除，显著提高测序数据中有效数据信息，实现RNA样本的经济高效测序。

（二）MaxUp系列rRNA去除流程

目前rRNA的去除方式以RNA酶消法为主，特别对于部分RNA降解样本（如FFPE样本）RNA酶消法更能展现其优势。

图1. MaxUp系列rRNA去除原理示意图

三、性能展示

（一） 植物样本

利用RNase H消化去除植物来源总RNA中的核糖体RNA，利用qPCR对比去除前后rRNA基因和mRNA基因的表达量变化：结果表明本产品能对植物中rRNA高效去除。

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图2.以1μg 拟南芥叶片 RNA进行rRNA去除，qPCR对比去除前后rRNA基因和mRNA基因的表达量变化

（二） 人/大鼠/小鼠类样本

利用RNase H消化去除植物来源总RNA中的核糖体RNA，建库后送测序，数据分析显示本产品针对该类样本中rRNA可高效去除。

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图3.分别以1μg人、小鼠、大鼠总RNA为样本， rRNA去除后建库测序分析rRNA残留

（三） 低质量RNA样本（如FFPE RNA）

低质量样本中往往ITS/ETS序列比例残留较多（参考下图FFPE RNA: DV200=20%），而这部分序列同样也会产生较多的无效数据，所以在低质量样本中通过新增ITS/ETS探针，可进一步有效富集目标序列。本产品中除了针对常规的45S Pre-rRNA的探针之外，还增加了Human 45S ITS/ETS区域的探针设计，在不影响常规样本中rRNA去除效果的基础上，确保对于低质量样本中的rRNA也能够更加高效的去除。

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图4. 增加ITS/ETS探针前后，rRNA残留以及ITS/ETS残留情况数据对比

四、订购信息

类型	名称	货号	规格
rRNA去除	Hieff NGS^® MaxUp rRNA Depletion Kit (Plant)	12254ES08/24	8/24T
rRNA去除	Hieff NGS MaxUp Human rRNA Depletion Kit（rRNA & ITS/ETS）	12257ES08/24/96	8/24/96T

HB210129