Hieff UNICON® qPCR SYBR Green Master Mix ( 抗体法,Low Rox)
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产品介绍

本产品是2×实时定量PCR扩增的预混合溶液。采用的抗体法热启动DNA聚合酶(货号:10113ES),在预变性温度(95℃)加热30sec,UNICON® Taq抗体失活,释放出Taq DNA Polymerase活性。抗体法热启动Taq酶可以有效抑制引物非特异性退火导致的扩增。同时,配方优化了有效抑制非特异性PCR扩增的因子和提升PCR反应扩增效率的因子,适合低浓度模板的扩增,使定量PCR可以在宽广的定量区域内获得良好的标准曲线。

Mix中含有Hieff® Taq DNA Polymerase、UNICON® Taq抗体、SYBR Green I、dNTPs、Mg2+及Low Rox。使用时,仅需在扩增体系中加入模板和引物即可进行实时荧光定量PCR,大大简化操作过程,降低污染几率。

产品特色
  • 特异性好
存储条件

-25~-15℃避光保存,有效期18个月。本品避免反复冻融。

产品中含有荧光染料SYBR Green I,保存或配制反应体系时需避免强光照射。  

FAQ

Q1:模板用量X 是多少?常用的量是多少?

A:(1)X 表示模板 DNA 量需要实验者在首次实验时进行摸索。首先对模板DNA 进行稀释(一般推荐 5-10 倍),然后模板量梯度上样,选择 CT 值落在  20-30  之间的最佳上样量。

(2)常用的量是逆转录 500-1000ng 总RNA,稀释 10 倍取 1μL cDNA 进行qPCR 实验。

Q2:qPCR 实验结果的有效性?为什么建议Ct 值要大于 15?

A:(1)有效性要满足三个条件:(1)标准曲线:扩增效率范围:90-110%,对应斜率为-3--3.5。R2>0.98。 (扩增效率=10-1/斜率-1),当斜率=-3.32 时,扩增效率=100%。

(2)扩增曲线:S 型曲线,且 Ct 值在 15-35 之间,阴性对照 Ct>35 或无Ct 值。
(3) 熔解曲线:为单一峰。(2)3-15 个循环的荧光值标准差的 10 倍是荧光阈值,Ct 值太小了会影响曲线。

Q3:Rox 的作用?

A:ROX 是一种参比染料,其作用是标准化荧光定量反应中的非PCR 震荡,校正加样误差或者是孔与孔之间的误差,提供一个稳定的基线。
Q4:为什么扩增曲线不稳定(扩增曲线平台期锯齿状)?
A:可能原因:a)RNA 纯度低,体系中存在较多杂质;推荐参数:OD260/OD280=1.8-2.0, OD260/OD230>2.0。随着 qPCR 反应的进行,阻碍反应的因素不断增加,若 RNA 纯度低,杂质多,会进一步影响仪器平台期的算法,导致出现锯齿状。

b)仪器长时间未做校准。仪器未校准会使仪器算法错误,导致各种异常结果。

解决方案:a)先梯度加大模板稀释倍数看优化效果。若效果仍不好建议新制备高纯度RNA 重新实验。

c) 定期(一般 1 年)进行仪器校准保养。

Q5:为什么扩增曲线无法达到平台期?

A:可能原因:a)模板量太低(CT 值 35 左右)。推荐 Ct 值:15<Ct<30。原因:Ct 值太大(如  Ct>30),刚进入指数扩增期几个循环就停止了反应,故无法到达平台期。

b)循环次数太少(30 cycles);循环次数过少(如 35)导致刚进入指数扩增期几个循环就停止了反应,故无法到达平台期。

c) 试剂扩增效率低(CT 小,但无法达到平台期,曲线比较“趴”)。

解决方案:a)提高模板量;参考 Q1 的优化方法。

b)提高循环次数;推荐循环数:一般 40。低丰度基因可设 45。
c)做标准曲线测定扩增效率,若确实偏低,则换试剂。

d)增加 Mg2+浓度(会增加非特异扩增)

Q6:为什么出现双峰,并且较低峰 Tm 在 80℃之前?

A:较低峰 Tm 在 80℃之前可能原因:存在引物二聚体(一般mRNA 反转录后定量,产物在 100-150bp 左右,峰对应 Tm 值为 80-90℃。若有引物二聚体存在,引物二聚体大小只有几十bp,峰对应 Tm 值在 70-80℃之间。故会在 80℃以前出现一个峰, 80℃以后出现一个峰),模板浓度过低或引物浓度过高。

解决方案:a)适当提高退火温度; b)提高模板量,降低引物浓度; c)重新设计引物。

Q7:为什么出现双峰,双峰 Tm 都在 80℃以前?

A:双峰Tm 都在 80℃以前的可能原因:做 MicroRNA 定量时存在引物二聚体。Micro RNA 反转录后定量, 产物在 80-90bp 左右,峰对应Tm 值为 70-80℃,若有引物二聚体存在,引物二聚体大小只有几十 bp,峰对应 Tm 值也在 70-80℃之间。故会在 80℃ 以前出现双峰。

优化方法:提高退火温度、降低引物浓度或重新设计引物等方式优化。Q8:为什么出现双峰,并且双峰Tm 都在 80℃以后?

A:可能原因:a)引物特异性过差导致非特异性产物扩增。
b)交叉污染。

c)gDNA 污染,可通过 NRC 进行确认。

解决方案:a)Blast 检查引物特异性,差则重新设计引物。
b)超净台中操作,注意更换 Tip 头,避免交叉污染。

c)通过 NRC 阴性对照进行确认,若有,需重新制备模板。

Q9:为什么是单峰,但 Tm 在 80℃之前?

A:可能原因:扩增产物是完全的引物二聚体,可能是未加模板。

注:若 microRNA,则结果正常(做 microRNA 定量时存在引物二聚体。micro RNA 反转录后定量, 产物在 80-90bp 左右,峰对应 Tm 值为 70-80℃,若有引物二聚体存在,引物二聚体大小只有几十bp,峰对应 Tm 值也在 70-80℃之间。故会在 80℃以前出现双峰)。

解决方案:进行高分辨率琼脂糖电泳,检测有无目的条带,以确定模板是否加入。优化方法:新配制无误的反应体系,重新实验。

Q10:为什么是单峰,但峰不尖锐?

A:可能原因:存在大小相近的非特异性扩增

解决方案:a)温度跨度不高于 7℃,视为可用结果(即 Tm 值跨度<7℃可认为是同一种产物);

b)进行高浓度琼脂糖电泳(高分辨率),确认是否为单一条带。

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已发表文献

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