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海量质粒和PCR产物,不想靠双手硬抗?看这里

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2026-05-29

全球质粒DNA制造市场规模2025年已达约283亿元人民币,研究级质粒DNA制造市场更9.8%的年复合增长率飞速扩张。全球已上市基因治疗产品达27款,AAV基因治疗市场CAGRs高达18.5%。数量极为庞大的质粒及PCR产物,正把越来越多的实验室推入“人肉高通量”的困境中。

质粒应用场景丰富多样

▶️ 基因克隆获取大量目标基因;基因库构建;基因序列分析

▶️ 基因表达蛋白质生产;功能研究

▶️ 遗传工程基因编辑;基因治疗;转基因生物

▶️ 基因调控研究启动子分析;转录因子研究;信号通路研究

▶️ 生物制药药物开发;疫苗制备;基因治疗药物

▶️ 教育和科研工具教学实验;科研工具

质粒构建中,提到PCR产物,曾经在实验室深夜熬夜做连接转化的你,是不是还有点头皮发麻?PCR产物纯化、酶切、回收、连接、转化、挑克隆、摇菌……一步都不能错,一步都不能停。好不容易跑完胶回收完片段,发现还得做大批量浓度测定,逐个上机、逐个记录、逐个归一化——光这一项,一个96孔板忙活一下午是常事。

而质粒提取,更是让人想摔移液器的存在。大通量下,每次加液离心加液离心,动作重复到机械。偏偏质粒抽提还得避开蛋白污染、RNA污染——低浓度质粒反复浓缩管用多了回收率低,离心管一多又容易拿错位置。一天做下来,手臂酸胀、眼神涣散,PCR产物质粒构建更是愁上加愁。全球数百万生命科学研究者,正在付出相似的时间成本和体力消耗

既然高通量时代已经到来,为何实验室的管理和操作还要停留在“手工作坊”模式下?面对数千万级的样本通量及高通量实验质控需求,传统手工流程效率低、出错风险高、难以批次一致——亟需标准化、自动化的全流程解决方案。

面对现实吧:你已经和这些痛点周旋太久了。

这些痛点,其实都可以靠一套科学完整的解决方案来化解。太阳成集团特别为质粒、PCR产物的大量处理开发了高通量提取、浓度测定与测序的全套体系。

▶️ 高通量提取:优化多种样本提取流程,适配自动化和96孔板操作,质粒DNA与PCR产物回收效率稳定可靠,让大通量制备不再挤占宝贵的实验时间。

▶️ 批量浓度测定:搭配经过优化的快速测定流程与清晰的记录模板,轻松完成几十上百个样品的一次性均匀上机读取,实现浓度自动记录,数据清晰可追溯。

▶️ 测序完整解决方案:从扩增、提取、浓度归一化到测序反应构建,每一步都经过测试与验证,有效降低手工误差,提高测序质量与成功率,让后续分析顺利落地。

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数据展示

1. 质粒自动化提取以及浓度测定

分别使用5 mL、10 mL、20 mL菌液进行质粒提取,质粒提取试剂盒18549ES搭配自动化提取设备80510ES进行质粒提取。提取得到的质粒进行浓度测定80576ES和琼脂糖凝胶电泳检测。结果显示,搭配自动化提取,不同体积的样本均能得到较高的产量和较好的完整性。

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图:琼脂糖凝胶电泳检测提取得到的质粒质量

2.  全长质粒测序(ONT以及Cyclone平台,片段化酶VS转座酶方案)

2.1 片段化酶方案

投入5~50 ng的质粒使用片段化酶方案13305ES进行质粒建库,在ONT平台进行测序,结果显示,不同投入量不同长度的质粒,在同样的实验条件,均能得到较好的全长质粒测序结果。

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图:ONT平台,5 ng和50 ng不同长度质粒进行全长测序的片段分布图

2.2 转座酶方案

使用转座酶方案对PUC19质粒进行三代纳米孔全长文库构建,最后使用Cyclone平台测序,最后结果显示,转座酶方案进行全质粒测序,片段更集中。

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图:Cyclone平台转座酶方案构建全长质粒文库的数据以及片段分布图

3. 质粒和PCR产物同源重组结果

分别用长度为72 bp~3000 bp长度的PCR产物与质粒进行同源重组10911ES,转化到大肠杆菌中,在LB平板上进行涂布,检测平板上单菌落的生长情况。结果显示,不同长度的PCR产物,均能形成有效的重组质粒。

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4. 质粒DNA残留检测结果展示

使用质粒DNA残留检测试剂盒搭配不同的qPCR仪进行质粒DNA残留检测,结果显示,本试剂盒在不同的qPCR仪设备以及不同样本间检测,一致性较高,符合《生物制品质量控制分析方法验证技术评审一般原则》的要求。

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产品推荐

实验步骤

产品名称

产品货号

质粒提取

磁珠法质粒小量提取

18541ES

磁珠法质粒去内毒素中量提取

18549ES

 无内毒素质粒大量提取

19037ES

96通道自动化核酸提取仪AP-96N

80510ES

浓度测定

dsDNA BR Assay Kit/ BR 双链DNA定量检测试剂

12643ES

核酸定量仪荧光计Qubit(96通道升级版)

80576ES

同源重组质粒构建

Hieff Clone® Plus Multi One Step Cloning Kit
多片段一步法快速克隆试剂盒

10912ES

质粒DNA残留检测

Plasmid DNA Residue Detection Kit
质粒DNA残留检测试剂盒

41323ES

质粒测序

Hieff NGS® PreMix Fast Tagment DNA Library Prep Kit for Illumina转座酶法建库试剂盒(二代质粒测序)

17214ES

Hieff® LongSeq Plasmid Fragmentation and Ligation Module(三代全长质粒建库)

13305ES

转座酶裸酶(包埋序列可定制)

12914ES

三代转座酶建库(不同测序平台试剂不一样)

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